En 1919, la Fédération Nationale de l’Enseignement Technique Catholique (FNETC) a été constituée. Elle a été suivie, en 1920, par la Fédération Nationale de l’Enseignement Normal Catholique (FNEMC) puis en 1931, par la Fédération Nationale de l’Enseignement Spécial Catholique (FNESC).

En 1996, la Fédération de l’Enseignement Spécial Catholique a été intégrée selon les niveaux, respectivement à la Fédération de l’Enseignement fondamental catholique (FédEFoC), d’une part, et à la Fédération de l’Enseignement secondaire catholique (FESeC), d’autre part.

La FESeC regroupe donc les établissements secondaires catholiques ordinaires et spécialisés.